肾盂肾炎是一种尿路感染疾病，主要由细菌感染引起，致病菌绝大多数为革兰阴性杆菌，以大肠杆菌最常见，主要感染途径是上行性感染，少数患者的肾盂肾炎来源于血行感染，极少数患者致病菌通过淋巴感染至肾脏。当患者的机体防御功能下降时，与致病菌抗争的能力减弱，最终引起肾盂肾炎。
一、主要病因
1、上行感染：病原菌经由尿道上行至膀胱，再到输尿管、膀胱引起的感染，约占其病因的95%。正常情况下阴道前庭和尿道口周围定居着少量肠道菌群，但并不致病。某些因素如性生活、尿路梗阻、医源性操作、生殖器感染等，可导致上行感染的发生。
2、血行感染：病原菌通过血运到肾脏引起肾盂肾炎，此种途径引起的肾盂肾炎比较少见，不足2%，多发生于患有慢性疾病或接受免疫抑制剂治疗的病人，常见的病原菌有金黄色葡萄球菌、沙门菌属、假单胞菌属和白念菌属。
3、淋巴道感染：盆腔和下腹部额器官感染时，病原菌可从淋巴道感染引起肾炎肾炎，但比较罕见。
二、诱发因素
1、医源性因素：导尿或者留置导尿管、膀胱镜和输尿管镜检查、逆行性肾盂造影等，可导致尿路黏膜损伤，将细菌带入泌尿道，引起尿路感染，继而诱发肾盂肾盂。
2、性生活：性生活时可将尿道口周围的细菌挤压入膀胱，引起尿路感染，细菌继续上行感染可引起肾盂肾炎。
3、泌尿系结构异常：如肾发育不良、肾盂畸形、移植肾、多囊肾等，也是导致肾盂肾炎的好发因素。
4、药物：长期应用广谱抗生素、糖尿病、大量应用免疫抑制剂以及接受化疗治疗等，导致机体免疫力低下，造成尿路机会性感染，进而累及肾盂。