大部分急性间质性肾炎都存在明确病因，因此首先是病因治疗，消除诱发因素。停用引起急性间质性肾炎的药物，有效控制和积极治疗引起急性间质性肾炎的原发性疾病和免疫性疾病，同时积极控制感染。
一、药物治疗
肾上腺皮质激素：如泼尼松，一般给予其足量4~6周后，逐渐减量至停用。用药6周无效提示病变已慢性化，继续治疗无收益，可停用泼尼松，不推荐使用大剂量甲泼尼龙冲击疗法。另外，此疗法适用于临床诊断为特发性急性间质性肾炎或免疫疾病引起的急性间质性肾炎以及药物相关性或感染相关性急性间质性肾炎患者、在停用敏感药物或感染控制后肾功能无改善者，或者肾脏组织病理检查可见肾间质明显的炎性细胞浸润或肉芽肿形成而纤维化不明显者。
二、手术治疗
急性间质性肾炎患者如治疗不及时出现肾功能衰竭，必要时可进行肾脏移植手术。
三、其他治疗
急性间质性肾炎并发肾功能衰竭出现尿毒症症状、肺水肿、高钾血症等血液净化治疗指征者，应实施血液净化治疗，可选择持续性肾脏替代、血液透析、腹膜透析等。自身免疫病引起的急性间质性肾炎，血浆置换治疗的有效性尚需进一步证实。