乳腺囊肿手术的费用，决定于该囊肿的临床特征和手术方式。临床上，如果乳腺囊肿直径小于1厘米，生长位置表浅，位于腺体表面，皮下软组织之内。这种情况的手术操作比较简单，则可以做门诊手术，不用住院，其总费用在二千元以内。如果囊肿直径比较大，超过1厘米，或者其位置位于腺体组织内部以及深部，手术难度就大一些，，此时需要住院手术，其总费用可能需要五千元左右。如果是做微创手术，做乳腺病灶旋切术，其总费用可能达到一万元左右。