隐匿性肾炎需要与生理性蛋白尿、慢性肾炎、泌尿系统感染进行鉴别。
1、生理性蛋白尿：生理性蛋白尿包括功能性蛋白尿和体位性蛋白尿，一般在患者剧烈运动、发热、低温刺激后，或处于直立体位出现，有时需要做肾活检进行辨别。
2、慢性肾炎：隐匿性肾炎无明显临床症状，或临床症状较轻，慢性肾炎患者会出现肾性水肿、肾性高血压等症状。
3、泌尿系统感染：隐匿性肾炎无明显临床症状，或临床症状较轻；泌尿系统感染患者会在出现血尿的同时，伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。