1、真菌镜检：医生通过取患者的痰液、血液、皮肤损害部位进行显微镜下观察，若直接看到真菌菌丝可明确诊断。
2、真菌培养：医生通过取患者分泌物提取的真菌在培养皿内培养，通过观察真菌的特有反应，形态学特征明确真菌的类型，有助于下一步的治疗。
3、组织病理学检查：属于有创检查，医生通过切取部分皮损部位制作成切片，在显微镜下观察明确致病菌类型，若发现真菌菌丝、孢子结构可以明确诊断。