原发性骨髓纤维化的并发症有门静脉高压症、脾梗塞、感染、髓外造血、骨硬化等。
1、门静脉高压症：发生率为7%，原因是骨髓纤维化会导致肝脾增大，脾脏增大引起的血流增加；细小门静脉血栓脱落导致肝梗塞，从而导致门静脉高压，主要临床表现有脾脏肿大、腹水、门体侧支循环的形成，肝和门静脉血栓形成及门脉高压性胃肠道出血。
2、脾梗塞：表现为左上腹部剧烈疼痛，伴有恶心，发热，左肩部不适。
3、感染：免疫功能低下可导致感染。
4、髓外造血：可导致消化道出血，脊髓压迫，癫痫，咳血和浆膜腔积液。
5、骨硬化：导致骨痛和不适。