载脂蛋白E偏低主要是由于疾病因素和非疾病因素导致的，需要根据病因进行治疗，具体如下：
1、疾病因素
肝病：载脂蛋白E主要由肝脏释放，当肝功能障碍合成蛋白减少，载脂蛋白E合成减少，血浆载脂蛋白E下降。原发病为肝硬化的患者，应采取综合治疗，包括病因治疗、对症支持治疗，其目的为预防和治疗各种并发症；肝炎患者需根据具体类型制定相应的治疗计划，主要为一般治疗和药物治疗，同时给以充足的休息、适当营养支持，以及避免饮酒、过劳和使用损害肝脏药物。
2、非疾病因素
脂肪摄入不足：正常人长期摄入脂肪不足，会导致载脂蛋白E下降。无需特殊处理，调整饮食即可。