因药物不易进入甲板，且甲生长缓慢，故甲癣治疗较为困难，其关键在于坚持用药。治疗周期一般为3~6个月，药物治疗分为口服药和外用药，对于严重的甲癣，外用药与口服药联合使用，可以明显提高疗效，但是甲癣有时临床治愈后还可能再发。
一、药物治疗
1、外用药物治疗：
（1）30%冰醋酸外涂或者10%冰醋酸泡病甲，持续3~6个月以上。涂药前可先将病甲刮薄，疗效较好。
（2）用40%尿素软膏包敷后使病甲软化剥离，再外用抗真菌制剂。
（3）5%阿莫罗芬擦剂，指甲需要持续用药6个月，趾甲需用药9~12个月。
2、系统药物治疗：
（1）特比萘芬：连续服药，指甲受累需6~8周，趾甲受累需12~16周。
（2）伊曲康唑：每月服药一周为一个疗程，指甲受累需2~3个疗程，趾甲受累需3~4个疗程。
3、联合治疗：包括口服药物和局部外用药物的联合，口服药物和(或)外用药物与非药物治疗的联合。一般用于患者甲板受累面积较大、甲母质受累或单一治疗失败时的治疗。
二、手术治疗
甲癣可通过手术方式拔除病甲，但是因手术治疗损伤较大，现一般不采用此种疗法。