氯碘喹啉乳膏，通常是不用于治疗滴虫性阴道炎的，它主要治疗皮肤或者黏膜的真菌性感染。而滴虫性阴道炎，并不是因为真菌感染所导致的，滴虫性阴道炎是因为阴道毛滴虫感染所导致的。
对于滴虫性阴道炎的治疗，目前临床上常用的是甲硝唑来进行治疗。因为滴虫除存在于阴道内，还存在于尿道等部位，所以不能够单纯通过外用的药物进行治疗。一般临床上最多见的是采取口服药物来进行治疗，例如口服甲硝唑，来达到治疗滴虫性阴道炎的目的。