动眼神经损伤，应该明确是何种疾病引起，针对病因进行治疗的同时，再给予营养神经、促进神经功能恢复的治疗。
常见引起动眼神经损伤的原因有：糖尿病性动眼神经麻痹、脑梗死或者脑出血，累及到动眼神经核、肿瘤或者占位，侵犯到动眼神经核，或压迫到动眼神经。
针对原发病进行治疗，糖尿病，要积极控制血糖；脑血管病要给予活血化瘀，或者是止血对症处理；肿瘤性疾病，则需要考虑能否切除肿瘤，解除压迫；对症治疗，则给予B族维生素，营养神经为主，常用维生素B1、维生素B12；也可以使用鼠神经生长因子。
具体疗程，根据患者恢复的程度来决定，可以在14天左右，也可以在两个月以上。