1、胸部X线检查：多表现为单侧病变，约占80％以上主要为右肺，大多数在下叶，有时仅为肺门阴影增重，多数呈不整齐云雾状肺浸润影，从肺门向外延至肺野，尤以两肺下叶为常见，少数为大叶性实变影。
2、咽拭子分离培养：用患儿痰液或咽拭洗液分离培养支原体是诊断肺炎支原体感染的可靠标准。
3、支原体抗体检测：临床上目前常用ELISA法(酶联免疫吸附测定法)检测肺炎支原体特异性IgM抗体，MP-IgM一般在病后１周可检测到，但病情越重MP-IgM出现越晚，阳性率越高，至第3~4周达高峰，以后降低2~4个月时消失。
4、核酸检测：此方法简便，特异性及灵敏度高，已经在临床上开始应用来检测肺炎支原体。
5、血常规、CRP、血气分析、血生化、Ｄ-二聚体等：白细胞数大多正常或稍增高，重症患儿可见有白细胞降低，血沉多增快，用于了解肺炎严重程度、病情变化及并发症等。