小儿急性化脓性甲状腺炎属于急性感染性疾病，常经血液运行或颈部感染蔓延而来，大多为葡萄球菌、链球菌或肺炎球菌等感染所致。
一、主要病因
小儿急性化脓性甲状腺炎主要是由于胚胎腮弓闭合不全等先天发育异常所致，如梨状窝瘘和甲状舌管残痕等。此外，还可由血行感染或颈部化脓性感染蔓延而来，致病菌多为金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌等阳性球菌，少见于大肠杆菌、克雷白杆菌、布鲁菌、沙门菌、放线菌、假丝酵母菌、寄生虫或梅毒等，在免疫力低下的患者亦可出现卡氏肺囊虫感染，厌氧菌也占一定比例。
二、诱发因素
1、疾病因素：当患儿已确诊败血症或颈部化脓性感染等疾病，可经血液运行，就近蔓延将感染扩散至甲状腺，引起炎症。
2、免疫力低下：熬夜、营养不良、接受化疗等导致机体免疫力低下容易出现真菌感染导致疾病反复发作。
3、医源性因素：甲状腺组织穿刺或注射药物治疗时消毒不严格。
4、其他因素：甲状腺手术后线结反应诱发感染。