肾囊肿一般不影响性功能，首先看肾囊肿它由膨大的肾小管的憩室构成，膨大的肾小管的憩室在膨大的过程中会和肾小管脱离形成独立的囊泡，囊泡可以分泌囊液，在分泌囊液的过程中囊泡会不断生长、逐渐长大。
在长大过程中可能对肾脏造成一定的刺激，比如它牵拉到肾脏包膜病人可能会感觉到肾区的隐痛，另外，压迫肾盂的时候也会有这种情况，除此之外如果压迫的肾脏的实质，它可能造成部分的肾脏实质的失功能另外也可能造成肾积水和尿路感染等等的情况，但是这些情况都不会影响到病人的性功能，所以针对病人肾囊肿的治疗主要是看大小位置、数量来决定。