通常治疗高同型半胱氨酸血症的药物，较有效的是使用小剂量叶酸，临床研究发现，每天补充叶酸0.8mg，可以降低同型半胱氨酸水平、脑卒中的发生率。目前临床用叶酸联合维生素B₆、维生素B₁₂服用，具有降低同型半胱氨酸的功效。另外，建议患者补充小剂量叶酸3个月后复查血象，查看相应指标。

此外，患者需要注意饮食调整，比如多摄入绿叶蔬菜，并且增加活动，改善循环代谢。同型半胱氨酸血症与高脂血症、血糖升高相似，属于不利于血管的代谢指标，升高后会促进血管动脉硬化，增加脑卒中、冠心病、高血压发病风险。因此，临床上较关注同型半胱氨酸的指标，并且进行日常生化检查时，也需观察该指标，出现升高后会给予相应处理。