大部分患者的卵巢巧克力囊肿能治好，但是百分之二十几的患者会复发。卵巢巧克力囊肿是年轻女性经常发生的一种良性疾病，能否治好主要取决于卵巢囊肿的大小和范围等。

巧克力囊肿指子宫内膜异位到卵巢，在卵巢处出血而形成的囊肿，分为大囊肿和小囊肿，小囊肿可能不会影响怀孕等。如果巧克力囊肿比较大，侵袭周围组织，使输卵管发生阻塞或者蠕动困难、拾卵困难，则可造成不孕症，对于此类患者需进行手术治疗。因此，对于卵巢巧克力囊肿的患者，除观察以外，还可行手术治疗，而手术治疗多采用微创手术的方法。