益生菌和益生元是临床上常用的两类药物，目前常用的益生菌包括双歧杆菌、地衣芽孢杆菌、枯草杆菌。这类药物可以定植在体内的某些部位与体内的有害菌群相互竞争，增加体内有益菌群的数量，可以调节人体内菌群尽量趋近于正常。

益生元本身是一类胃肠道不吸收的物质，可以对体内的益生菌起到营养支撑的作用。益生元可以作为益生菌的养料或原料，体内本来就有很多益生菌，有时体外可以相应的补充益生菌，体内需要营养成分，而益生元恰好可以辅助促进益生菌的增长。这样能够更多地提高益生菌的效果，所以两者有相辅相成的作用。益生元既可以辅助体外所使用的益生菌的效果，也可以增加体内的有益菌群的生长，起到辅助治疗效果。