扁桃体区的乳头状瘤是良性的肿瘤，主要是黏膜上皮在各种致瘤的因素的作用下，包括抽烟、喝酒、病毒感染引起，即人乳头状瘤病毒感染。

此外，吸入空气中化学物质、吃的东西比较粗糙，不停刺激上皮则同样会慢慢使其发生瘤变，特别是肿瘤的形状往往类似于乳头样。因为呈局限性生长，所以会看到乳头状，因此将其称之为乳头状瘤。