枕大池蛛网膜囊肿实际是颅内蛛网膜包绕脑脊液形成的非肿瘤性良性结构，并不是普通意义上的肿瘤，也不是恶性病变，患者一般不会有明显的临床表现和临床症状。枕大池蛛网膜囊肿因枕大池所处的生理位置特殊，如果囊肿增大比较明显，则病人会出现走路不稳、共济失调、头晕、恶心、呕吐等症状。
有极少数，大约10%不到的病人可能在发育过程中由于囊肿的进行性增大，增大到一定程度会压迫到周围脑组织、神经、血管，可能会有颅内压增高的症状，如头痛、头晕、恶心、呕吐。囊肿若压迫到局部的脑组织，根据这部分脑组织的作用会引起相应偏瘫、肢体麻木、语言障碍等临床症状。