牙齿补完后总是隐隐作痛，原因包括深龋、裂纹、牙髓炎等，具体如下：

1、深龋：牙齿龋坏较深，且补完牙未进行完善垫底；

2、裂纹：牙齿隐裂；

3、牙髓炎：牙髓充血逐渐发展为牙髓炎。

具体病因需根据患者牙齿情况和实际感受综合判断，牙裂或牙髓炎发作时可能需要进行根管治疗，将牙髓以及炎症组织、坏死组织等全部清理，疼痛便可得到相应解决。根管治疗后再进行全冠修复，可使牙齿基本恢复正常。另外，如果牙齿龋坏较深，未采取垫底，需进行髓腔单层垫底或双层垫底，再进行补牙。