头骨通常指颅骨，出现凹陷的原因主要有以下几种：
1、生理性因素：颅骨在发育过程中，形成的颅骨骨性凹陷，凹陷局部质地比较硬，和周围颅骨没有明显差异；
2、病理性因素：如头颅受到暴力打击或者撞击之后，形成的颅骨凹陷性骨折，以及颅骨的其他病理性改变，导致患者出现颅骨凹陷。如颅骨的嗜酸性肉芽肿，和颅骨骨膜窦、颅骨骨髓瘤、颅骨转移瘤等，由于局部发生骨质吸收，进而将软组织逐步填充形成凹陷。另外，对于炎性的病变，如结核性的颅骨改变，或者颅骨骨髓炎等，同样可以造成颅骨局部的凹陷。对于病理性的凹陷，通常局部的质地偏软，有时可以触摸到周围的颅骨骨缘，并且在触摸时有不同程度的疼痛感。
综上所述，颅骨凹陷的原因较多，建议患者出现凹陷后应及时到医院就诊，由神经外科医生通过一系列的检查，帮助分析凹陷的具体原因。
