巧克力囊肿在非经期出现隐痛，可能是粘连。少部分巧克力囊肿患者会疼痛，大部分患者可能会月经期疼，非月经期疼可能是由于粘连所导致。巧克力囊肿是子宫内膜月经期出血所致，异位内膜通过输卵管异位到卵巢，卵巢会出血，使周围形成包裹的纤维素或纤维细胞增生，形成陈旧性血包，即巧克力囊肿。

巧克力囊肿形成即粘连的过程，所以大部分巧克力囊肿患者有粘连。巧克力囊肿的疼痛症状因人而异，粘连形成的过程也是炎症发展过程。部分患者感觉敏锐，粘连的部位特殊，如骶韧带或者是直肠前，甚至可能到直肠和阴道纵隔，此时疼痛比较明显，同房时会明显疼痛。