肝功能正常或不正常，针对于受检者是否是有乙肝并没有直接的关系。肝功能正常的受检者，仍然有可能是乙肝病毒的感染者，而肝功能异常由于引起原因较多，除乙型肝炎外，还有丙型肝炎、甲型肝炎、戊型肝炎等病毒性肝炎外，还有酒精性肝炎、药物性肝炎、自身免疫性肝炎等，均可引起肝功能异常，因此肝功能异常并不一定便是乙型肝炎。

临床上还有种情况是乙肝病毒的携带者，其概念是肝功能正常、肝脏没有受损，而且连续化验多次肝功能均正常，但检查乙肝五项，可能是大三阳或者小三阳，因此并不是存在乙肝病毒感染后，一定会引起肝脏的受损，或引起肝脏的炎症。乙肝病毒跟人体免疫系统之间存在免疫识别的问题，如自身免疫系统不识别病毒，即免疫系统针对病毒不产生免疫攻击，此时人体与病毒便会处于和平共处的状态，因此肝功能正常，并不意味一定没有乙肝病毒感染。