如果患者刷牙时牙齿酸痛，其原因可能较多，具体如下：
1、龋病：最常见的是患者有可能刷牙时牙齿患有龋坏，特别是患有中龋，甚至是深龋。在刷牙过程中，牙刷毛刷到牙齿的窝洞处，也就是接近牙齿的牙神经地方，就可能会出现牙齿的神经感受器接触到机械，以及物理刺激，从而表现出牙齿的酸痛不适。对于此情况，应该及时到正规医院的口腔科，或口腔医院的牙体牙髓病科，找专业的牙医进行及时检查，给予相应的去龋、冲洗、消毒、隔湿、吹干后，再进行窝洞的充填修复，对于深龋的患者，甚至要进行盖髓、安抚及垫底等相应治疗；
2、楔状缺损：对于部分患者有楔状缺损，在进行刷牙的过程中，可能刷毛刷到楔状缺损的部位，从而使牙齿牙本质小管内的神经触碰到相应刺激，从而表现为刷牙牙齿酸痛。对于此类患者，建议按巴氏刷牙法刷牙，并且选择软毛牙刷，另外要注意刷牙的频率、方向、力度等，尽量地减少对牙齿的刺激，就可以改善刷牙牙齿酸痛的问题。
