面肌痉挛手术在短时间之内，效果非常好，一般做完手术之后，基本上可得到缓解。术后有部分患者几周之后，面肌痉挛可能再次发作，这是它最主要的问题，就是做完之后有一部分的复发率。

此外，可能在手术过程中损伤到面神经，引起面瘫，例如嘴巴歪了。还有可能损伤到后组颅神经，引起喝水呛咳、吞咽困难等，但随着手术技术的逐渐成熟，并发症已非常少。所以主要的问题还是术后的复发率，部分患者因术后复发还需要进行药物治疗。