50年前婴儿期发生的急性梗阻性脑积水为致命性疾病，1岁之内死亡率可达50%，10岁之内死亡率可达75%。现在可进行脑室腹腔引流，有效降低死亡率。目前15岁之内的死亡率只有50%，但是在这活着的50%的患者当中，可能有15%的患者合并有智力低下，所以脑积水预后还是要根据原发病的情况判断。

通常新生儿发病的脑积水与结构异常或在宫内的损伤、出生时的损伤有关，容易导致智力低下、运动障碍。成人脑积水多与外因相关，如进行有效病因学治疗，控制肿瘤感染、免疫的因素，可以得到较好预后。对成人放置脑室腹腔引流，成功率可以达到60%-80%，但也会有相应并发症。一年之内的失败率大概在25%-40%，寿命一般在5年左右。