卵巢早衰通常通过检查血中的激素水平来确诊，医生会开具性激素检查化验单。根据患者血液中的FSH(促卵泡激素)、LH(黄体生成素)和雌二醇激素量的高、低来进行初步判断。若患者的FSH＞10miu/ml，LH＞10miu/ml，且逐渐升高，雌激素水平也在正常水平下逐渐降低，提示卵巢的水平在逐渐下降。若卵泡刺激素FSH和黄体生成素LH＞40miu/ml，雌二醇(E2)＜5mmol/ L，基本到达绝经的水平。
若患者的卵巢功能已逐渐减弱，需确诊时可能会进一步加查卵泡储备功能，即AMH抗缪勒氏管抗体的激素。若结果＜2ng/mL，再结合上述情况，基本上卵巢早衰的诊断可以成立。卵巢早衰有一定的年龄界限，以40岁为分界线，绝大多数患者是40岁左右，特别是40岁之前出现月经稀发或闭经的情况，因此需到医院就诊。
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