扁桃体发炎首选的消炎药是青霉素类或头孢类抗生素，因为急性扁桃体炎，最常见的致病菌是乙型溶血性链球菌，它对青霉素类和头孢类抗生素比较敏感。但如果患者对青霉素类或头孢类药物过敏，成人患者建议使用喹诺酮类抗生素，即沙星类抗生素。

儿童患者对青霉素和头孢过敏，不能使用喹诺酮类抗生素，建议使用阿奇霉素等红霉素类抗生素，对扁桃体炎有明显的治疗效果。急性扁桃体炎，患者要尽早使用抗生素，如果出现扁桃体周脓肿，患者还应全身使用糖皮质激素进行治疗。扁桃体炎反复发作，建议进行手术，切除双侧的扁桃体。