男性患儿阴茎较小原因较多，具体如下：

1、阴茎自身较小：足月新生儿阴茎长度需达3cm或成年后小于均值百分位以下。小阴茎属于特定概念，因为部分患者无垂体、肾上腺、睾丸、性腺轴，导致激素分泌异常所致阴茎较小，即属于小阴茎；

2、隐匿型阴茎：阴茎海绵体发育正常，但陷于海绵体内，外推海绵体即可显露阴茎。此类情况需进行手术治疗，将阴茎表面纤维素带去除，使阴茎更好显露；

3、埋藏式阴茎：患儿体重较重、腹部肥胖，即耻骨前脂肪较厚，致使阴茎陷入脂肪内。