任何手术均存在风险，隐睾手术风险多为睾丸下拉情况及对血管、输精管影响、伤口感染问题。如睾丸发育较差、位置较高，血管发育较短可能需进行分次手术治疗。手术时影响睾丸血管、血供，可能引起睾丸血供变差，导致睾丸萎缩。如存在出血、血肿、感染也可能造成手术失败，但一般风险较低，多处于可控范围内。

如患儿存在隐睾，不应因顾虑手术风险而错过隐睾最佳治疗时间。隐睾最佳治疗时间为6-12个月，最迟不应超过18个月。