对于急性的咽炎和扁桃体炎，以抗生素治疗为主，需要医生根据症状、咽喉部红肿程度以及扁桃体发炎的程度，选择口服或者静脉输液的方式进行治疗。对于明显发烧的患者，可以加用退烧药、物理降温，以及在输液时加用糖皮质激素。并且建议患者，每天使用漱口液漱口3-4次，进行局部的消毒、杀菌。另外，也可以使用中成药，进行中西药联合治疗，比如蓝芩口服液、蒲地蓝消炎口服液，对于急性咽喉炎也有明显的治疗作用。
对于慢性咽喉炎和扁桃体炎的治疗，一般不使用抗生素进行治疗，大部分以中成药为主，包括百蕊片、甘桔冰梅片，或者六神丸等。另外，还可以进行雾化吸入治疗。
