一般情况下，肺泡灌洗是有它的适应症的。如果患者有适应症，同时没有明显的禁忌症，是可以做肺泡灌洗的。肺泡灌洗是利用支气管镜，向支气管肺泡内注入生理盐水，并随即把它抽出来，收集肺泡表面的澄液，检测细胞成分以及可溶性物质的方法，来帮助诊断肺部的一个疾病。
它的适应症主要是肺部感染、肺癌及其它肿瘤，肺部间质性疾病，如结节病、肺泡炎。
如果患者有严重的心肺功能不全，近期出现急性心肌梗死，新近的大咯血、活动性肺结核，没有治疗的，不能纠正的低氧血症，严重的心律失常，一般情况比较衰弱，麻醉药过敏，主动脉瘤有破裂危险者，这些患者是禁忌做支气管肺气泡灌洗的。