女性患者进行导尿术需要两次消毒。第二次消毒顺序为先消毒尿道口周围，而后向四周放射到小阴唇及女性阴道口，再向外辐射到大阴唇至大腿内侧，最后消毒肛门附近。与第二次相反，第一次消毒顺序为由外向内，先消毒阴阜，而后逐渐向内对大腿内侧及大阴唇进行消毒，最后消毒小阴唇。
二次消毒与一次消毒顺序相反的主要原因为正常女性阴道口附近及尿道口周围存有细菌，第一次消毒需由清洁到有菌区域进行消毒，消毒完毕后即可认定小阴唇及尿道口周围处于无菌状态。
第二次消毒是由内向外，从尿道口向四周放射，通过两次消毒以确保女性尿道口附近不存在细菌及病原体，这时可在无菌下进行导尿。
