甲状腺功能异常对妊娠会有一定的影响的，特别是一些严重的甲亢或者是甲减，都有可能造成胎停育或者流产。中国以及国外的一些研究显示，甲状腺功能的轻度异常可能会造成下一代的一些生长发育方面的问题。有些表现在智力发育方面会影响到下一代的神经系统的健康发育。所以母亲的甲状腺功能异常对胚胎的发育以及下一代的包括神经系统的发育会产生特殊的影响。
所以对于妊娠期的母亲，甲状腺功能是一个重要的需要做检查和进行评估的指标。另外，对于有桥本氏甲状腺炎或者是过氧化物酶抗体增高病史的患者，需要更加积极地去控制促甲状腺激素的水平，使其达标，这样更有利于妊娠的安全。在妊娠期出现甲状腺功能异常，特别是TSH水平超过或者低于正常值范围，容易导致妊娠的失败。所以，妊娠期妇女或者是计划怀孕的妇女，都建议做常规甲状腺功能的评估来确保妊娠的安全。