胃底间质瘤是否严重，这个问题很难单独提出来。因为胃间质瘤最常好发的部位就是胃底，胃底的间质瘤占到了胃间质瘤的一半以上。所以更多的患者是发生于胃底的间质瘤。但是胃底间质瘤有其相应的特点，具体情况如下：
1、不严重：如果胃底的间质瘤偏向于大弯侧，大部分的情况都可以通过胃的局部切除，就可以把肿瘤切干净；
2、严重：如果胃底的间质瘤非常邻近食管胃结合部，即俗称的贲门，这个位置的手术难度就会相应增加。同时，如果过大的胃底间质瘤，把食管胃结合部侵犯的范围过广，还有可能需要做近端的胃切除，可能会让胃做部分切除，才可以把肿瘤彻底切干净。
胃底间质瘤并不是因为发生于胃底，其病理特点、疾病转归就比其他位置差。但是这个位置有时会涉及到食管胃结合部，可能会造成额外的手术相关的不良因素，可能会给手术增加一定的困难，这些是客观存在的问题。
但是其疾病转归以及预后，还是主要与危险程度相关，即高危、中危、低危还是极低危。其危险程度最终决定预后，而并不是因为长在胃底，决定其预后。
