临床上有时会做腰穿检查，如脑炎患者，或者还有其他需要诊断时，也需要做腰穿。腰穿长期的并发症是头痛，主要与腰穿以后放脑脊液而引起的低颅压有关。在临床中需要测颅压以及颅内压，而腰穿结束以后也要测末压。注意穿刺时不能反复且多次穿刺，否则会引起脑脊液漏，进而会引起低颅压。

脑脊液是支撑人体脑以及脑组织，如球一般浮在液体中，如果脑脊液减少，会导致脑脊液对脑的支撑力量减弱，进而脑组织会向下拉下沉，而引起的下拉则会导致头疼。如果腰穿后放脑脊液过多或脑脊液漏，都会导致低颅压发生，从而导致头疼。