临床不建议应用酒精湿巾对肛门进行擦拭，肛门组织比较柔嫩，表面皮肤是单层的鳞状上皮，类似嘴唇的皮肤，容易受到刺激性化学物的损害。酒精对柔嫩皮肤的刺激比较大，因此肛门既不能用酒精湿巾，也不能用酒精棉球擦拭。应避免应用含有其他消毒物质的清洁品擦拭肛门，比如使用杀菌肥皂，或者沐浴露等日化产品专门清洗肛门。

清洗肛门时建议清水冲洗即可，在手术时可消毒肛门皮肤。肛门处的微生物会形成比较稳定的微生物小环境，也是肛门处的第一层保护层，可有效阻挡大部分外来微生物的入侵。