健脾丸和归脾丸有一定差别，主要是功效作用与用药时间不同。
1、功效作用：健脾丸由党参、白术等中药材制成，具有健脾开胃的功效，多用于脾胃虚弱所导致的腹泻、便溏、脘腹胀满等消化方面的不适症状，而归脾丸的功效侧重于益气健脾、养血安神，往往治疗心脾两虚所引起的症状，不仅是消化不良，还可以治疗健忘、失眠、心悸、气短等症状；
2、用药时间：对于健脾丸，如果应用3天疗效不明显或者治疗作用不明显，就应该停药，而归脾丸的应用，一般在4周左右才会有比较好的疗效。
虽然两种药都为甲类非处方药，可以不在医院和医生指导下用药，可以在药师指导下选择和使用，但建议如果有条件，还是应该在中医诊断下，中医规范诊疗以后来决定适合哪种药，适合健脾丸还是归脾丸，结合医生诊断用药，并在医生处方指导下使用。
