系统性红斑狼疮若不积极治疗，造成重症狼疮或影响重要靶器官，例如狼疮脑病、狼疮肾损害、尿毒症或者急性肾衰，甚至危重狼疮，均会造成生命危险。

随着科学以及医学进步，近几年狼疮死亡率降低，尤其是5年生存率和10年生存率取得较大进展。如果早期诊断、早期规范化治疗，尤其是保护重要的靶器官，可使狼疮患者的死亡率明显降低。目前死于狼疮脑病、狼疮肾炎、尿毒症的人数有较大程度降低，可见狼疮的生存率得到较大提高。如果患者不注意治疗，出现多个器官受损甚至衰竭，将可能造成患者早亡。