一般腔内的彩色多普勒超声是指阴道和直肠的彩色多普勒，从阴道或肛门进入，这两种彩色多普勒都有专门探头。常见分为阴道彩色多普勒及直肠彩色多普勒，具体如下：
1、阴道彩色多普勒：探头可伸入阴道中，此为妇科较为常见的伸入阴道中的检查项目。此时其可一直顶到阴道顶端，即宫颈旁边，此时观察子宫、卵巢都较为清晰。其距离较近，看得较清楚，因此妇科检查往往为做阴道的彩色多普勒检查；
2、直肠彩色多普勒：未婚女性可能会做直肠的彩色多普勒，男性查前列腺也可做。彩色是指其可观察到血流变化，血流朝向探头即为红色的，背离探头即为蓝色，医生据此可判断血流的丰富程度。其为动脉或静脉血流的图像不同，因此其不仅出现形态改变，且可看到多普勒声波。
