颅内生殖细胞肿瘤，切的不彻底或者术后综合治疗得不到有效控制，就容易复发，复发率一般在10%-37%左右。

除了向周围邻近的颅内、脑神经周围占位效应之外，还可以向远端转移，常沿着蛛网膜下腔向基底池脑室系统和脊髓转移。五年、十年的生存率，颅内生殖细胞瘤有96%和93%。随着时间延长，增殖期越来越短，复发率越来越高。复发以后需要进一步根据病情变化做治疗，如果占位效应比较明显，还需要再次手术或者放化疗。