如果患者患有牙齿的根尖囊肿，要对根尖囊肿进行相应评估，根据评估结果，再决定相应的治疗方案：

1、保守治疗：如果根尖囊肿非常小，直径不超过0.5cm，多半可能采取保守治疗，就是对牙齿进行根管治疗，通过根管治疗的方法，看是否能将根尖囊肿治愈。根管治疗就是进行牙齿的开髓引流，然后进行牙齿的根管预备，再进行根管消毒，根管打通以后，将药物灌注到根尖区，通过这种方法，看是否能够将根尖囊肿消除；

2、手术：就是通过手术的方法，这种多半是对于根尖囊肿稍微大一点的患者，例如直径已经超过0.5cm，甚至达到1cm以上的患者。在进行根管治疗以后，还要进行开窗，也就是将牙龈切开翻瓣，然后找到根尖囊肿的部位，将根尖囊肿挖除，然后再进行缝合，通过这种治疗，才有可能将根尖囊肿治愈。