导致生化妊娠的原因比较多，可能是胚胎自身的原因，也有可能是母体疾病或者接触不良的环境因素所导致，具体情况如下。

1、胚胎自身的原因：生化妊娠指的就是受精卵在子宫内膜着床失败，进而导致的一种早早期的自然流产。其原因有很多，可能是胚胎自身的问题，比如胚胎染色体异常、胚胎发育异常等。此外，有时夫妻双方之一存在平衡易位或者罗氏易位的携带者，有可能会出现反复的生化妊娠；

2、母体的原因：生化妊娠也有可能是母亲的疾病所导致，比如子宫内膜异常、子宫内膜息肉、子宫内膜炎、宫腔粘连等，导致子宫内膜容受性下降，进而可能导致生化妊娠。部分子宫的畸形也会导致生化妊娠，如纵隔子宫等，同时子宫内膜异位症和子宫腺肌症也有可能会导致生化妊娠。部分免疫性或者凝血功能异常，如抗磷脂综合征，可能会导致反复生化妊娠，伴有抗磷脂抗体升高，还有血管栓塞损性。多囊卵巢综合征的患者、甲状腺异常的患者也可能会导致生化妊娠的发生。

此外，也可能与母亲在早孕期接触不好的环境因子有关系，如抽烟、酗酒、咖啡因等，还有毒物、重金属等，都有可能会导致生化妊娠的发生。