输尿管结石微创手术是从尿道内进入输尿管，操作时间一般比较快，通常是1个小时以内。但如果患者输尿管内结石较多，肾脏内也存在结石，硬镜操作下只能观察到输尿管内结石，因此需要更改成输尿管软镜操作。肾脏容积较大，需要不停寻找结石，所以手术可能需要1小时左右。

如果输尿管和膀胱连接部的开口不能顺利进入，如部分患者长期出现结石嵌顿或输尿管开口较小，则输尿管硬镜操作时比较困难。如果患者同时存在输尿管息肉现象，通常不能进行一期碎石手术治疗，需要留置双接管，等到2-4周输尿管扩张后，再进行二期手术治疗。部分老年男性患者前列腺增生明显，也会影响进镜顺畅程度，不能达到一期碎石，同样需要进行二期手术治疗。