大部分NT检查经腹都能够完成，经腹超声是最常用的超声，在孕妇的腹壁耻骨上拿腹部探头做超声。另一种叫阴式超声，部分孕妇过于肥胖，经腹超声看不清，则可选择阴式超声，将阴式探头放入阴道，透过阴道、子宫看胎儿结构。所以经腹超声、经阴超声都可以完成NT检查，但大多数情况下选择经腹超声。

此外，胎儿NT是在特定的时间段测定胎儿颈项、颈背部透明层的厚度、皮下透明层的厚度，最佳检测的时间窗是妊娠11-13周+6天，超过此时间段检查可能不准确，所以NT检查的时间窗很重要。