化脓性角膜炎分为不同病因，比如细菌、真菌或病毒都可导致化脓性角膜炎。根据不同分类，致病微生物不同，治疗方式也不同。不同角膜炎都要采取药物治疗，如果细菌导致，要采取抗细菌药物，比如左氧氟沙星、妥布霉素等常用抗生素局部点眼，如果为病毒导致，用更昔洛韦、阿昔洛韦等眼药水进行局部治疗。

如果为真菌导致的化脓性角膜炎，可应用纳他霉素、伏立康唑、特比萘芬等抗真菌药物进行治疗。根据导致化脓性角膜炎的不同病因，会针对性治疗，所以患者到医院就诊，一般建议检查病因，根据不同病因、不同微生物感染，采取敏感药物进行有效治疗。