阿米巴角膜炎是由于阿米巴原虫感染角膜导致的角膜感染，角膜感染后称为阿米巴角膜炎。阿米巴是一种原虫结构，根据不同生长时期，有不同结构，比如有包囊结构、滋养体结构。由于原虫生长有一定周期，所以潜伏期较长，可以几天、几个月，治疗时间也较久，且针对阿米巴没有特别有效药物。 比如接触到不干净自来水或污染水源后，配戴角膜接触镜，接触到角膜伤口，角膜上皮不完整，也就是黑眼珠结构不完整时，感染可能当时没有明显症状，也没有明显角膜炎。但几周后，会有眼睛红、疼、视力下降等症状发生。