囊肿型淋巴管畸形的治疗首先要明确诊断，淋巴管畸形大部分发生在头颈部，通常需要判断病变发生的部位和大小，除体格检查，还要通过影像学检查，比如磁共振，可以看到病变范围与周围组织的关系。磁共振检查以后，甚至可以做穿刺检查，可以抽出草黄色淋巴液样的液体，但是这种液体外观类似于鸡蛋清，但是不粘、不容易凝固。这些检查大致可以判断是否是囊性淋巴管畸形。

对于囊性淋巴管畸形的治疗，主要还是根据病变大小、所处位置关系，确定治疗方案。如果病变比较浅表或者是单一，而且病变又比较小，单纯的手术可以达到非常好的治疗效果。但是如果病变范围很大，位置又很深，累及到比较重要的解剖结构，比如气管、喉或会厌，单纯的手术治疗可能会引起比较大的功能障碍。这时可能会结合手术和硬化剂的治疗控制病变的发展。病变越大，复发比例越高，可能需要通过反复的治疗达到比较好的治疗效果。