尿路结石的病因，并没有研究的特别清楚。总体来讲有以下原因：
1.喝水比较少；
2.饮食上高嘌呤、高蛋白饮食较多；
3.感染性结石，由尿路感染的细菌引起；
4.解剖异常，例如输尿管狭窄，解剖畸形导致排尿不通畅，导致尿液引流不通畅，容易出现继发结石；
5.遗传因素。