舌咽神经痛发病早期，疼痛轻微，可吃卡马西平、奥卡西平类药物，抑制神经传导冲动，缓解疼痛，但不能根治。随着病程延长，疼痛越重，频率越高，范围可能逐渐扩展。首选针对病因的治疗，采取舌咽神经根部减压术，或者采取舌咽神经选择性切断术、射频消融术等进行治疗。