舌咽神经痛不是不治之症，只要及时有效的治疗，大多数患者可以达到临床治愈。临床上治疗舌咽神经痛主要采用微血管减压术，术后绝大多数患者疼痛可消失。部分患者无明确原因，且影像学检查未见异常，相对来说治疗的效果不如三叉神经痛和面肌痉挛。